孔林，除碑石如林、石仪成群、累累墓冢外，还有四万余株林木，成占地两平方公里的茂密的古典式人造混交园林，真可谓一座天然的植物园，郭老曾赞誉为“很好的自然博物馆”。

　　相传，孔子死后，“弟子各以四方奇木来植，故多异树，鲁人世世代代无能名者。”那时林地小，故植树的量不多。此后，自汉至今，孔林大规模植树有十次之多。孝文帝太和19年，皇帝幸鲁祭祀孔子，并起园栽柏。明成化七年，宪宗皇帝来曲阜，对孔林及神道进行了大规模的植树，共千余。孔子六十一代孙、孔宏泰重修孔林，增建洙水左右二桥的同时，栽侧柏等数百株。康熙二十三年，扩充林地后，将五百多株侧柏植于园内。为便于管理，乾隆五十年，对孔林树株分界清点，共三千一百六十二株。

　　孔林树木来自人工和自然，历史悠久，是座“活化石”博物馆。林中现有植物六百多种。其中，草本植物四百多种，木本植物31科、72种，4万余株林木中，有9445诛古树名木被国家列为一、二级“活的文物”，成为园林科研的活资料。林中，槐、杨、枫、柳、女贞、五味、樱花柏等大树，盘根错节，枝繁叶茂；野菊、半夏、柴胡、太子参、灵芝等植物，也依时争容。历代文人墨客多有咏赞诗句：

　　“郁郁园中柏，青青池畔草。”“斯文命脉真依庇，合抱森森松楷阴。”

　　孔林的古树名木近万株，分10个科12个品种，为侧柏、楷、槐、桑、榆、紫藤、合欢。软枣、沙枣、楸等。其中，最为称道的是楷树。相传，楷树是孔子弟子子贡由南海带回孔林的。楷树属于漆科，是落叶乔木，皮呈鳞状，叶狭长浅绿色，经霜变红，还是一种漂亮的观赏树，故人称“文楷”。每到深秋，楷叶红透，分外妖娆，为曲阜八大胜景之一。楷生于孔子冢上，因“其干枝疏而不屈”，与河南周公墓前其叶四季色异且纯的“模树”相对应，“楷模”一词便由此演变而来。

　　曲阜有三宝：楷仗、如意、和蓍(shi)草。楷仗、如意的原料均是楷树，木质坚硬而柔韧，木纹细腻，呈金黄色，稍加雕刻，古朴可爱，玲珑剔透，为历代孔府向皇帝进贡的供品。宣统末年，德国人瓦根从曲阜带走的作品《百子如意》，在巴黎万国博览会获得金奖。

　　“洙桥流接真源远，楷木根含化雨深”子贡手植是一颗树，给后人带来许多的荣耀，留给后世永世不泯的美。

　　曲阜三宝之一的蓍草，是孔林特产。蓍草，多年生草本植物，茎直立，花白色，有棱，俗称“锯齿草”。因可入药，可制作香料，故称为“神草”。清康熙皇帝祭孔时，专门在孔林中寻找蓍草，加以观赏。此后，孔林的蓍草身价倍增。如今，来曲阜的旅游者中有许多游客是专门寻蓍草的，把它买回家，做为来曲阜朝圣的纪念。

　　孔林不仅是一个生长奇木异草的大植物园，还是一个天然的中草药库。在“林深五月寒”的孔林中，气侯温湿，很适于林下植物的生长，使林下植物生长茂盛，构成了自然的植物群落。春夏，主要有老鸦瓣点、地梅阔、叶麦冬、垂穗苔、披针苔、草米口袋、紫花地丁、班种草、盾果、草野菊、甘野菊、牡蒿、野艾蒿、金叶马兰等 。屋顶和林墙上也有作为植物群聚，如地黄、黄蒿、野菊、绿 苋、鬼针草、瓦松、狗尾草、画眉草等。如茵如酥，万紫千红。孔林药用植物多达150余种，这一药用植物景观不仅在山东独有，在华北平原也是罕见的。